Der er i alt ca. 100 ansatte på Stutgården.

Til hvert barn er der knyttet et tværfagligt team bestående af pædagoger, lærere, psykolog og socialrådgiver.

I hvert hus arbejder et team af pædagoger med miljøterapeutisk uddannelse, og husene ledes af en afdelingsleder, som er i de respektive huse hver dag. I hvert hus er også en husmor, som står for husholdningen samt menuplanlægning og indkøb.

I den interne skole, Stutgårdsskolen, underviser ca. 10 lærere fordelt på to afdelinger. Stutgårdsskolen ledes på tilsvarende vis som dagafdelingen og de tre døgnafdelinger af en skoleleder.

De tre socialrådgivere og fire psykologer, foruden forstanderen, på Stutgården er tilknyttet hvert sit hus og har dermed indgående kendskab til de børn/unge, de behandler.

Udover det team af tværfagligt personale, der har direkte kontakt med børnene og de unge på Stutgården i det daglige, er der også en administration, som består af forstander, administrationsleder, en administrativ koordinator, en organisationskoordinator, bogholder samt pedel.